Instruments de mesureComptage des levures avec ... une webcam.

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Nezahualcoyotl
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Re: Comptage des levures avec ... une webcam.

Message par Nezahualcoyotl »

Penn-Maen a écrit :est-ce que la source de lumière pourrait en partie être responsable ?
Je ne le pense pas .

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Re: Comptage des levures avec ... une webcam.

Message par Cede »

Je pencherais plus pour la qualité d'optique.
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Re: Comptage des levures avec ... une webcam.

Message par Hush »

J'ai essayé diverses sources lumineuse : led, incandescence, lumière naturelle sans changement notable. Je crois que le problème provient de l'optique. L'objectif n'est composé que d'une lentille en plastique. On manque de résolution et de contraste. Pour améliorer le système, il est possible de remplacer cette lentille unique par un objectif de microscope.
https://publiclab.org/notes/bronwen/05- ... conversion
Cette modification améliore probablement la résolution et le contraste mais entraîne d'autres problèmes : le système tige filetée écrou n'est plus assez précis pour faire une bonne mise au point et si l'on continue à complexifier on réinvente le microscope compound avec toute sa série de lentilles :lol:
Une publication qui décrit ce type de "cam-croscope". On voit figure 2 les limites du système, couleurs grises et reflet lumineux.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26282117
Hush
qui ne veut pas perdre son âme pour un plat de lentilles optiques :jesors4:
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Re: Comptage des levures avec ... une webcam.

Message par Aza- »

J'imagine que ce n'est pas possible de mettre un filtre de couleur / une ampoule de couleur qui permettrait de faire ressortir la couleur bleue ?
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Re: Comptage des levures avec ... une webcam.

Message par goulven »

Alors, moi je suis d'accord avec tout le monde! :)

Ça peut venir de l'optique ou encore de l'éclairage. Et ce que tu viens de dire Aza concernant un filtre de couleur est très intéressant puisque le dernier microscope que j'ai acheté, est équipé d'un filtre bleu et ça améliore considérablement les contrastes (c'est fait pour ça). Et dès que je peut m'acheter l’adaptateur pour mon apn je vous montre tout ça (et surtout les différences)!

@Coyotl: Pour le protocole, bien entendu que c'est sur la manière de compter. J'entendais par protocole 'particularités de la cellule' (taille et volume…). J'ai regardé la neubauer improved, elle me parait toutefois moins intéressante que la Malassez sur le fait que selon la concentration de levures(quand on a 5 cellules dans un grand carré), on ne peut pas choisir la taille des carrés a compter. Mais sinon entièrement d'accord avec toi .
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Re: Comptage des levures avec ... une webcam.

Message par Hush »

Interposition de filtre jaune, bleu, vert, rouge ... Pas d'amélioration :roll:
Si on regarde sur les premières photos, on voit que les cellules apparaissent comme de points brillants avec un tour plus foncé mais très mal défini. Le fond reste toujours très gris même si on augmente l'éclairage. Ce manque de définition n'est pas du à une mauvaise focalisation.
D'un autre coté que l'on n'obtienne pas le même résultat avec une vulgaire lentille plastique et un microscope multi-lentilles avec mécanisme de déplacement ultra précis ce n'est pas vraiment étonnant.

Hush qui refuse de se mettre en Köhler.
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Re: Comptage des levures avec ... une webcam.

Message par Nezahualcoyotl »

Hush a écrit : Hush qui refuse de se mettre en Köhler.
C'est un tord mais cela a un coût!

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Re: Comptage des levures avec ... une webcam.

Message par jaaf »

Une petite question qui peut paraître naïve, mais tant pis, je me risque.
Sachant qu'une cellule de Malassez mesure 5 mm2 soit un carré de √5=2.23 mm de côté et que la cellule comprend 100 rectangles, ces rectangles sont donc des carrés de 0,223 mm de côté.
Sachant par ailleurs que 1 pouce vaut 24,5 mm, les carrés subdivisionnaires font donc environ 1/100 e de pouce.
Si je mets la cellule de Malassez sur mon scanner d'imprimante avec une résolution de 9600 points par pouces, j'aurais une résolution d'environ 100 points par côté de carré subdivisionnaire.
Cela n'est-il pas suffisant pour compter mes cellules ? Au vu des images que j'ai vu dans ce fil de discussion, ça me paraît jouable.
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Re: Comptage des levures avec ... une webcam.

Message par Loic06 »

Belle résolution pour un scanner ! C'est du 9600 x 9600?
En tout cas, je dirais que ça ne coute rien de tenter
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Re: Comptage des levures avec ... une webcam.

Message par jaaf »

Si quelqu'un qui dispose d'une cellule de Malassez pouvait essayer ça m'éviterait de l'acheter peut-être pour rien.
Par ailleurs, 9600 dpi c'est le max qu'indique mon logiciel (XSANE sous Linux). La documentation du scanner dit " ResolutionUp to 19200  19200 dpi (interpolated)3Up to 2400  2400 dpi (optical) (Scanner Glass)Up to 2400  1200 dpi (optical) (ADF."
Je ne sais pas trop ce qu'il faut attendre du mode interpolé. Sans ce mode nous serions à environ 20 points par petit carré.
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